论文临床医学命名实体识别的病历质量筛选标准，该文是临床医学相关在职开题报告范文和临床医学和病历和筛选方面论文写作参考范文.
【摘 要】电子病历包含大量的重要的临床信息资源,通过人工智能手段对其进行分词、挖掘,建立临床医学命名实体数据库,可深度开发利用病历.分析了医学命名实体识别与电子病历的关系,指出病历记录内容不真实、不完整、不规范以及模板使用与拷贝雷同等是影响临床医学命名实体识别的问题,提出应从基本标准、内在逻辑、单项否决标准3方面建立病历质量筛选标准,并及时调整.建立标准筛选合格病历,是提升临床医学命名实体质量的有效举措.
【关键词】电子病历；临床医学命名实体；病历质量；筛选标准
电子病历 (Electronic Medical Record, EMR) 是指医务人员在医疗活动过程中使用医疗机构信息系统生成的文字、符号、图表、图形、数据、影像等数字化信息, 并能实现存储、管理、传输和重现的医疗记录［1］.随着《国务院关于印发新一代人工智能发展规划的通知》［2］、《国务院关于促进“互联网+医疗健康”发展的意见》［3］的发布,以及机器学习、深度学习等人工智能手段的应用,使得长期制约电子病历应用的瓶颈-对自由文本进行自然语言处理难题得到有效解决,也使得通过对电子病历进行分词、挖掘建立临床医学命名实体数据库成为可能.在此基础上,开发人工智能辅助临床决策支持系统,将极大地提升基层医疗机构的临床诊断决策能力.但在临床医学命名实体数据库建设过程中,电子病历本身的质量将直接影响数据库质量.本研究就临床医学命名实体数据库中如何筛选符合条件的电子病历进行探讨,以期为后续工作开展提供参考.
1医学命名实体识别与电子病历的关系
电子病历包含大量重要的临床信息资源,运用分词、命名实体识别等自然语言处理技术识别这些信息,并用于构建临床辅助诊断决策支持系统,可打破医生在知识上的局限,减少人为疏忽.同时,可改变医生收集科研数据时依赖阅读病历、手工抄录数据的传统做法,为科研数据收集和临床数据库建立提供全新手段.
1.1医学命名实体识别及方法
命名实体识别(Named Entitiy Recognition, NER)是指识别文本中具有特定意义的主体,包括人、地名、机构名、专有名词等［4］.命名实体本质上是词,具有独立、完整的意义,一般包括3大类(实体类、时间类、数字类)和7小类(人名、地名、机构名、时间、日期、货币、百分比).命名实体识别最常用的方法有3种：（1）基于规则、基于词典的有监督机器学习法；（2）基于少量的标注语料,对未标注语料自动标注扩充模型的半监督学习法；（3）通过深度学习自动提取未标注语料的统计特征,利用其产生分词结果的无监督分词法.
1.2电子病历临床医学命名实体与实体的关系
临床医学命名实体识别的主要任务是从电子病历文本中识别出具有独立、完整意义的医疗领域的命名实体.这些命名实体主要涉及与患者接受医疗诊治相关的实体,包括症状、体征、疾病诊断名称、手术操作名称、药物名称、辅助检查名称等.不同研究者有不同的分类方法,主要有5大类实体：（1）患者、医生以及医疗机构的名称、编号等隐私信息 (Private Health Information, PHI).使用电子病历的先决条件就是去隐私化信息 (De-Identifi cation),用替代信息替换病历中的 PHI, 以保持病历文本的完整性.（2）医疗问题类（Problem）实体［5］.指描述患者身体或精神上由疾病引起的异常现象的短语,即疾病和症状,如“肺炎（疾病） ”“咳嗽（症状）”“胸痛（症状）” 等.同时,抽取疾病和症状的重要修饰成分（或者称上下文特征）,比如“无高血压病”,表示肯定排除.因此,电子病历命名实体识别研究还需要识别疾病和症状的修饰,方能准确表达电子病历的内容含义.（3）检查类（Test）实体.指为了诊治疾病开展的各项检查等,如“病理”“血常规”等.（4）治疗类（Treatment）实体.指诊治疾病的治疗干预措施,如“地塞米松（药名）”“百多邦（药名）”等.其不仅涉及药物名称 (包括通用名、商品名), 还包括剂量、用药方式、频次等被视为药物属性的命名实体.（5) 时间信息.这也是一类重要的实体数据.患者的治疗和病情的发展有时序性, 在病历中很多表示事件的实体都与时间相关,比如 “恶心呕吐3小时”.
电子病历临床医学命名实体识别既要识别病历文本中表达患者症状体征及医疗过程的实体,又要体现电子病历实体之间的相互关系.实体关系主要有3大类［6］：（1） 概念之间的关系.包括疾病和症状的关系,疾病和疾病的关系,疾病和检查的关系,以及疾病和治疗的关系；（2）概念间的等价关系.有些概念可能是其他概念的等价表达,这种关系的识别是共指消解的主要研究内容；（3）概念和时间的关系.表示事件的概念通常具有时间属性, 即什么时间发生的某个事件.
临床医学命名实体与临床医学术语不同.术语是在特定学科领域用于表示概念的称谓的集合,医学名词术语是临床医学中的专业用语；命名实体则是自然语言处理的产物,是从信息抽取角度来定义的,不仅包括医学名词术语,还包括名词术语的多种表达方式以及修饰词.医学名词术语讲究统一规范,命名实体则存在一词多种变体,故要进行词义归一.
1.3临床医学命名实体识别与病历结构特征的关系
电子病历由结构化数据和非结构化数据组成.其中,自然语言自由文本形式的非结构化数据是电子病历中最重要的部分,包括入院记录、病程记录、会诊记录、出院记录等.《病历书写基本规范》对病历书写的每一个项目均有明确的格式和内容要求.同时,病历书写分客观病历记录和主观病历记录两部分.因此,对电子病历进行分词和命名实体识别之前,要了解病历书写各项目的含义和功能,只有在掌握病历书写结构特征的前提下方能选好语料,设计好分词提取方案.
1.4临床医学命名实体识别与病历书写语言特点
为便于同行间信息的传递和沟通,《病历书写基本规范》要求“病历书写应规范使用医学术语”.病历作为专业档案,其语言表达具有鲜明特点：（1）具有大量对疾病、症状、体征进行描述的医学术语；（2）有大量检查检验报告、药物剂量名称、数字及单位；（3）有大量对命名实体进行修饰的常用语,如“无”“不伴”等.
2影响临床医学命名实体的问题
电子病历临床医学命名实体识别主要涉及与患者接受医疗诊治相关的实体,因此,评判一个命名实体及关系是否被正确识别,其核心取决于原始文本本身的真实性、完整性,病历结构是否符合规范,语言逻辑是否清晰等.电子病历取代手写病历,在带来方便的同时,也带来了系列问题［7］.这些问题将直接影响病历内涵质量,进而影响对临床医学命名实体及实体关系的抽取和识别.
（1）病历记录内容的真实性.个别医生临床基本功不扎实,问诊查体不认真,事前遗漏重要内容,事后随意编写,导致病历内容失真.少数医生拷贝病历张冠李戴,如未手术患者出现手术切口描述,男性患者出现月经史,左侧白内障手术误写成右侧等.
（2）病历记录内容的完整性.已做手术缺手术记录,出院缺出院记录,重要的病理报告未归入病历,入院记录缺专科情况等.
（3）病历记录内容的规范性.未按规范要求格式和内容书写病历,导致病历内容不全；病历记录中出现大量错字、漏字、别字；同一份病历记录,前文写有青霉素过敏,后文又否认青霉素过敏,相互矛盾等.
（4）病历模板使用和拷贝雷同现象.病例特点与现病史相同,上级医师查房内容与首次病程记录拟诊讨论内容相同,多次病程记录内容相同等.这些雷同内容不能客观真实地反映患者情况.
（5）病种诊疗过程不完整.或因患者原因,或因医疗原因,导致诊疗过程未按既定方案完成.再如,有疾病诊断,没有诊断依据；有手术操作名称,没有手术操作记录等.
（6）新旧病历在病历记录中使用语言存在较大差异,尤其是近年来网络语言的兴起,病历语言与既往习惯的常用表达方式相比有较大变化,给命名实体识别带来阻碍.
（7）病历中出现大量不规范中英文缩写等.
3建立筛选病历质量标准
在开展临床医学命名实体识别前,可参照《病历书写基本规范》要求建立入选病历标准,筛选合格病历进行临床医学命名实体识别.
3.1基本标准
住院病历书写项目格式及框架符合《病历书写基本规范》要求,无项目遗漏,无内容缺失.住院病历包括入院记录、病程记录、出院记录等,且每个书写项目均具有完整内容,如出院记录应包括入院情况、入院诊断、诊治经过、目前情况、出院诊断、出院医嘱等6部分内容.缺少任何书写项目,缺少书写项目中任一部分内容,均评判为不合格病历,不能入选.
3.2内在逻辑
在电子病历中建立临床医学命名实体,进行实体间关系的抽取和识别,是为人工智能辅助临床决策支持服务,因此,病历本身内在的逻辑性、临床推理即临床思维过程非常重要.病历中对病情变化、异常情况的分析与处理等内容不可或缺.
3.3单项否决标准
病历内容出现以下情况之一,导致病历内容不能真实反映诊疗过程,应评判为不合格病历,不能用于临床医学命名实体库建设.（1）两次以上病程记录内容相同；（2）使用模板,导致同一病种症状体征大致相同；（3）病历内容出现张冠李戴、前后不一致等影响内容真实性的问题；（4）病种病历诊疗过程不完整；（5）病种病历主要诊断缺少依据等.也可根据提取的临床医学命名实体的具体用途调整病历筛选标准,以提高临床医学命名实体整体质量,为后续工作提供强有力支撑.
4结语
通过人工智能手段对电子病历进行分词、挖掘,建立临床医学命名实体数据库,是深度开发利用病历的重要手段.基于电子病历的临床医学命名实体及关系识别,具有内容广泛、知识密集、专业性强等特点,与病历记录有着千丝万缕的联系.病历记录不真实、不完整、不良拷贝等将使病历内容失真,不能客观反映真实的疾病诊治过程,不能准确表达医生的临床思维过程,严重影响病历质量,进而影响临床医学命名实体及实体关系的正确表达.因此,建立标准筛选合格病历,是提升临床医学命名实体质量的有效举措.
参考文献
［1］国家卫生计生委医政医管局.卫医政发〔2012〕24号电子病历基本规范［S］.2012.
［2］国务院.国发〔2017〕35号国务院关于印发新一代人工智能发展规划的通知［Z］.2017.
［3］国务院.国办发〔2018〕36号国务院关于促进“互联网+医疗健康”发展的意见［Z］.2018.
［4］Grishman R,Sundheim B.Message Understanding Conference-6: A Brief History［J］.COLING,1996,96：466-471.
［5］Uzuner ,South B R,Shen S,et al. 2010 i2b2/VA Challenge on Concepts, Assertions, and Relations in Clinical Text［J］.Journal of the American Medical Informatics Association,2011,18（5）：552-556.
［6］杨锦锋,于秋滨,关毅,等.电子病历命名实体识别和实体关系抽取研究综述［J］.自动化学报,2014（8）：1539.
［7］韩润芳.浅析电子病历内涵质量的主要影响因素与对策［J］.现代医院管理,2010,36（6）：55-56.
总结,这篇文章为关于临床医学方面的大学硕士和本科毕业论文以及临床医学和病历和筛选相关临床医学论文开题报告范文和职称论文写作参考文献资料.
参考文献：
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